瘟疫在古代史料中早有记载。如《周礼·天官·冢宰》记载：“疾医掌养万民之疾病，四时皆有疠疾。”

《吕氏春秋·季春纪》记载：“季春行夏令，则民多疾疫。”

说说明当时对瘟疫的认识已经达到了一定水平，认为瘟疫一年四季皆可发生，原因之一是由于时令之气的不正常，是由非时之气造成的。

史书上关于瘟疫的记载多不胜数，对于起源也有一定认识，但了解极少，这时代，人们对于不了解的东西归于鬼神，他们认为瘟疫是人物触怒了神灵，上天这才会令瘟神，散遍瘟疫，惩罚世人，有许多地方是敬拜瘟神的，香火不断，如同后世拜邪神的。

朝廷大军进军水西，是有这方面的准备的，并就面对这恶劣的环境展开适应性训练，每一个士兵都配备有水壶，不得喝生水，配备有治疗蚊叮虫咬的药包，每个兵都有口罩，并听闻抽烟叶可以驱赶蚊虫，米柱还让人在福建带来大批烟叶，供士兵们抽，这都是没有办法中的办法。

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